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En coursGénomique du riz 3K-RGP
Analyse de la diversité génétique et de la structure des populations de riz à partir du dataset 3000 Genomes Rice Project (3K-RGP). Pipeline Snakemake complet.
SnakemakePLINKVCFtoolsR
Projets
Pipelines bioinformatiques, projets de recherche et initiatives scientifiques
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En coursTBV Pfs48/45 — Vaccin anti-paludéen
Conception d'un candidat vaccin bloquant la transmission de Plasmodium falciparum. Vaccinomique inverse : prédiction d'épitopes B et T, modélisation structurale, validation par docking.
NetMHCpanIEDBAutoDock VinaAlphaFold2
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TerminéCriblage anti-VIH — Protéine p24
Criblage virtuel de 100 composés naturels de la base CNP contre la protéine de capside p24 du VIH-1. Meilleur hit identifié avec −8.99 kcal/mol.
AutoDock VinaPythonCNP DatabasePDB
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SoumisTolérance à la sécheresse — Vicia faba
Étude phénotypique et biochimique de génotypes de fève sous stress hydrique. Analyse des indices physiologiques et biochimiques de tolérance.
RStatistiquesPhénotypageMDPI
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Code source sur GitHub
Les scripts, pipelines et notebooks de ces projets sont disponibles sur le GitHub de GenoLabGab.
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