Axes de recherche en bioinformatique computationnelle
Développement de pipelines NGS automatisés : contrôle qualité (fastp), alignement (BWA-MEM), détection de variants (bcftools/GATK), annotation fonctionnelle (SnpEff). Application en génomique des populations (projet riz 3K-RGP).
Criblage virtuel de composés naturels contre des cibles protéiques d'intérêt thérapeutique. Utilisation d'AutoDock Vina, modélisation par AlphaFold2/ColabFold, visualisation moléculaire (PyMOL, ChimeraX, Discovery Studio).
Conception de candidats vaccins par approche vaccinomique inverse. Pipeline TBV ciblant Pfs48/45 (Plasmodium falciparum) : prédiction d'épitopes (NetMHCpan, IEDB), modélisation structurale, docking avec récepteurs immunitaires.
Co-auteur d'une étude sur la tolérance à la sécheresse chez la fève (Vicia faba) — analyse phénotypique et biochimique sous stress hydrique. Soumis à Agronomy (MDPI).